У 46-летнего Хабенского есть 11-летний сын Иван от первого брака. Его мать, журналистка Анастасия Смирнова, умерла от опухоли мозга в декабре 2008 года, сейчас Иван живет в Испании с бабушкой. Мальчик часто общается с отцом, но, как признался сам Хабенский в интервью, больше по телефону - даже когда гостит в Москве: у актера и режиссёра так много работы, что времени ни на что больше не хватает.
Константин Хабенский и Ольга Литвинова на вручении премии "ТЭФИ", октябрь 2018 года:
Недавно 34-летней Литвиновой пришлось публично развенчивать слухи о близящемся разводе с Хабенским: "Бывают такие ситуации, когда очень хочется, во что бы то ни стало, развенчать все мифы, домыслы, догадки, взятые «с потолка», и рассказать, как оно на самом деле, потому что очень обидно бывает читать про себя всякую ерунду!
А с другой стороны, это ничего не изменит!
Должна быть женщине какая-то загадка)"